J'ai résolu temporairement mon problème en ajoutant le paramètre true pour l'appel à la fonction FlattenText pour le libellé de la question soit

$pdf->intopdf(FlattenText($fnames[$i][2], true).": ".FlattenText(getextendedanswer($fnames[$i][0], $idrow[$fnames[$i][0]])));

dans printanswers.php

Sorry, can you explain your problem in English please?

En fait, de manière plus précise, le libellé de la question est mal encodé alors que le texte d'aide l'est.
Export PDF is working fine except with the label of the questions where all the french extra characters (like é è à ...) are not well encoded.
I got around it by adding the true value to the seconde parameter in the Flattentext fonction with is called in printanswers.php
$pdf->intopdf(FlattenText($fnames[$i][2]).": ".FlattenText(getextendedanswer($fnames[$i][0], $idrow[$fnames[$i][0]])));
becomes
$pdf->intopdf(FlattenText($fnames[$i][2],true).": ".FlattenText(getextendedanswer($fnames[$i][0], $idrow[$fnames[$i][0]])));
Thanks for the adding the correction.
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Thank you for providing this patch!